ウィンドウコントロールにz-indexが効かないIEの仕様
IE 5.5以上でのこの問題の解決は、比較的新しいJavaScriptの技法と、IFRAME要素の動作に関する変更のおかげで、驚くほど簡単です。
selectタグなどIE上の表示でWindowsコントロールを使っているものはz-indexが効かないんですね。そういう仕様らしい(MSDNドキュメント)。で、直す方法をさがしてたらBEAのサイトに説明がありました。
で、MSDNには本当に書いてある。
The property does not apply to windowed controls, such as select objects.